はい、通信速度が低下することがあります。
セキュリティ対策ツールは、パソコンに電源が入っている時には常に動いて(常駐)おり、定期的にチェックも行いますので、セキュリティ対策ツールをインストールしていない状態よりは若干速度は低下します。
また、パソコンの性能により、さらに通信速度が遅くなる可能性があります。
通信速度の改善ポイントについて 「セキュリティ対策ツール」の動作用件について 「セキュリティ対策ツール for Android」版について