はい、通信速度が低下することがあります。
「セキュリティ対策ツール」は、パソコンに電源が入っている時には常に動いて(常駐)おり、定期的にチェックも行いますので、「セキュリティ対策ツール」をインストールしていない状態よりは若干速度は低下します。
また、パソコンの性能により、さらに通信速度が遅くなる可能性があります。
速度改善について詳しくは、こちらをご覧ください。

「セキュリティ対策ツール」の動作用件について

「セキュリティ対策ツール　for Android」版について